Clary Fray solo quiere que su vida vuelva a la normalidad, pero resulta imposible. Por un lado, su madre todavía está en el hospital, en un coma misterioso. Por otro lado, ella y su hermano, Jace, han caído bajo una nube de sospecha ahora que el mundo de los cazadores de sombras sabe que Valentine todavía está viva, y que Jace y Clary son su hijo y su hija. Sin mencionar que alguien en Nueva York está matando subterráneos y drenando su sangre, creando un clima de sospecha que lleva al subterráneo de Manhattan al borde de la guerra civil. Cuando los Hermanos Silenciosos son asesinados y el segundo de los Instrumentos Mortales, la Espada de las Almas, es robado, el aterrador Inquisidor es enviado desde Idris para investigar. Claramente guarda rencor personal contra Jace, y abre una brecha entre él y su familia adoptiva. Cuando el romance de Clary con su mejor amigo, Simon, comienza a calentarse, Jace se siente abandonado. Pero, como acusa el Inquisidor, ¿se ha unido a su padre? Luego, Simon se convierte en vampiro y es secuestrado por Valentine, quien tiene la intención de sacrificarlo como parte de un ritual sangriento que hará que los Instrumentos Mortales sean suyos para siempre. Jace sabe que necesita salvar la vida de Simon, por el bien de Clary. Pero, ¿y si es demasiado tarde? ¿Qué pasa si Valentine ya ha hecho suyo Mortal Instruments?